There is some more information about stubs here:
http://www.php.net/manual/en/phar.fileformat.stub.php
Должно быть написано в ближайшем будущем. Перед чтением этого обязательно прочитайте Как использовать Phar-архивы.
Отличным началом будет чтение про Phar::buildFromIterator() и об особенностях выбора доступного для архивов формата файла. Хорошее понимание того, что из себя представляет заглушка (stub) и что она имеет решающее значение для создания phar-архива, и поэтому Phar::setStub() и Phar::createDefaultStub() также будут хорошей отправкой точкой. Если вы распространяете веб-приложение, ключевыми будут знания о Phar::webPhar() и связанном с ним методе Phar::mungServer(). Любое приложение, которое обращается к своим собственным файлам, должно учитывать возможность использования Phar::interceptFileFuncs().
There is some more information about stubs here:
http://www.php.net/manual/en/phar.fileformat.stub.php